Mikrobiol. Z. 2022; 84(4):40-47.
doi: https://doi.org/10.15407/microbiolj84.04.040

Пошук інгібітора fimH методом молекулярного докінгу для Escherichia coli,
виділеної з клінічних зразків пацієнтів з ІСШ

А.А.Р. Альнуаімі¹, М.С. Алсаїд¹, Х.М. Аболмаалі²

¹Медичний коледж Вавилонського університету
Вавилон, 51001, Ірак

²Університет КербелиA
Кербела, 56001, Ірак

Кишкова паличка є одним із найважливіших мікроорганізмів, яка викликає інфекцію сечовивідних шляхів (ІСШ) у понад 95% пацієнтів. Метою даного дослідження є пошук інгібіторів (fimH) методом докингу з використанням комп’ютерних програм та спеціалізованих для цього веб-сайтів. Методи. У цьому дослідженні відібрано 63 зразки кишкової палички у пацієнтів з ІСШ у період з лютого 2021 року по жовтень 2021 року з іракської лікарні в Кербелі. Для виявлення FimH та прогнозування відповідних інгібіторів було проведено повне лабораторне дослідження на E. сoli. Була використана система швидкої ідентифікації VITEK-2, проведено виділення ДНК, ПЛР молекулярний докінг, а також дослідження інгібітора FimH на тваринах. Результати. FimH виявлено в більшості ізолятів E. coli, a саме в 61 (96,82%) з 63 зразків. Показано, що ромашка є хорошим інгібітором FimH з показником докингу –9,4 і зменшувала прояви ІСШ приблизно у 50 відсотків досліджених щурів. Висновки. Було зроблено припущення, що ромашку можна використовувати як відповідний інгібітор (fimH), і були проведені її випробування на щурах. Результати показали, що ромашка має гарну інгібуючу властивість; крім того, вона безпечна і має інші переваги.

Ключові слова: E. coli, молекулярний докінг, FimH, UPEC, інфекція сечовивідних шляхів.

Повний текст (PDF, англ)